小型微波萃取設備在微波萃取過程中,攪拌同樣可提高溶質組分由固體表面向溶劑主體擴散的速率,且微波可加快溶質組分在固體內部的遷移速度,即可提高固體內部的傳質速率，因而提取速度更快，提取效率更高。微波在提取過程中，由于存在微波作用下的分子運動，因而溫度不需要與傳統提取工藝過程中的一樣高。此外，微波提取的時間很短，因而可降低被提取成分因受熱而發生破壞的危險，并可降低能耗。
    小型微波萃取設備濃度差是被提取組分擴散與傳質的前提，沒有濃度差或濃度差很小，提取過程就不能進行。傳統提取工藝中設法提高濃度差的種種工藝手段同樣適用于微波提取過程。溶劑的選用十分重要，適宜的溶劑可提取出所需要的組分，若溶劑選用不當，則不能獲得理想的提取效果。

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