微波殺菌設備是一種物理殺菌方法，不需要添加任何化學產品就可完成殺菌，并且不會對食品產生放射性物質的污染，也不會殘留毒性。在同樣的溫度下，所需殺菌時間短，不需要預熱，并且殺菌效果好。微波可對物料表里同時實施整體殺菌，縮短殺菌的周期，以及保證殺菌一致性。
微波殺菌設備的應用范圍廣，一般可對以下產品進行滅菌加工處理：
1.對面包、月餅、面條、豆腐、豆腐干等糧食類進行處理；
2.對泡菜、竹筍、香菇類等蔬菜類進行處理；
3.對荔枝、龍眼等水果類進行處理；
4.對奶制品、調味品、香精香料、方便面湯料、火鍋調料等進行處理。
